1、取水许可证的延续。
取水许可证将要到期，可以在届满前45日之内，携带原取水许可证、延续申请书、法人身份证及复印件，经办人身份证及授权委托书，到当地的政务大厅水务局窗口，办理延续手续。
2、注销许可证的处理方法。
因为连续二年停止取水，取水许可证被行政机关注销的，可以重新申请取水许可证，提交的材料和原先审批的材料差不多，还需要水资源使用评估报告以及第三人的承诺书等。
3、不可抗力导致过期的处理。
由于自然灾害等不可抗力，导致取水许可证过期的，可以向税务部门提供相应的证据材料，向原审批机关申请，经过同意后可以保留原取水许可证。
4、重新办理。
因生产经营发生变化，取水地点、方式、数量发生重大变化的，就必须按照新办理的程序和材料重新办理了。根据取水地点不同，分别向省市县水务部门提出申请，除申请书外，还有分析论证报告、相关批文等其他材料。
5、换法人变更申请。
生产经营单位法人更换或者股权转移等事项发生，需要携带相关变更的材料和原取水许可证到水务部门办理变更取水许可证。
6、权宜变通。
关于取水许可的程序和内容，各个省、自治区、直辖市执行的标准不完全相同，而且对于不同取水地点、方式的管辖权也是不同的。在补办之前，应当到当地水务部门去询问清楚，根据工作人员的要求，准备相关材料，按程序办理。
