1、呼吸道疾病。儿童肥胖胸壁脂肪堆积，压迫胸廓扩张受限，顺应性降低，横隔运动受限，影响肺通气功能，使呼吸道抵抗力降低，易患呼吸道疾病。
2、免疫功能低下。儿童肥胖的免疫功能低下，尤以细胞活性明显降低，因而易患感染性疾病。
3、血脂高。儿童肥胖血脂明显高于正常儿童，而血脂紊乱是动脉粥样硬化的高危因素。
4、脂肪肝。重度儿童肥胖脂肪肝发病率高达80%，儿童肥胖是诱发脂肪肝的重要危险因素，高血压、高血脂是肥胖儿童发生脂肪肝的危险信号。
5、性早熟。儿童肥胖男性血睾酮含量及女性血清脱氢表雄酮硫酸酯含量明显高于正常儿童，体脂增多可引起肾上腺激素分泌量增多，使下丘脑对循环中性激素阈值的敏感性降低，出现性早熟。性发育提前可引起性意识，会较早产生对性的迷惑、恐惧、焦虑等不良心理状态，影响儿童学习和生活。
6、智商低下。肥胖儿童的总智商和操作商低于健康儿童，其活动、学习、交际能力低，久而久之会出现抑郁、自卑，使儿童对人际关系敏感、性格内向、社会适应能力低，影响儿童心理健康。