南板蓝根与北板蓝根的区别：
1、来源不同
板蓝根又称北板蓝根，为十字花科植物菘蓝的干燥根，气微，味微甜而苦涩；南板蓝根为爵床科植物马蓝的根及根茎，气微，味淡，在南方地区亦作板蓝根使用。
2、二者药性不同
北板蓝根具有清热解毒，凉血利咽之功效，南板蓝根可用于外感发热，咽喉肿痛 。
3、所含成分不同
北板蓝根含有芥子苷、靛蓝、靛玉红，南板蓝根则不含芥子苷。
4、作用不同
芥子苷为抑菌成分，因此，北板蓝根较南板蓝根而言，具有对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌、腮腺病毒有作用答案补充 北板蓝根含有芥子苷、靛蓝、靛玉红，南板蓝根则不含芥子苷。芥子苷为抑菌成分，因此，北板蓝根较南板蓝根而言，具有对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌、腮腺病毒有抑制作用。
参考资料来源：百度百科-南板蓝根
参考资料来源：百度百科-北板蓝根